آموزش بیوانفورماتیک

آشنایی با پایگاه TarBase v9.0: پایگاه داده جامع میانکنش میکروارنا و ژن ها

: TarBase v9.0 یک پایگاه داده جامع است که به طور مداوم در حال رشد است و میزبان داده های تجربی پشتیبانی شده miRNA-gene است. این پایگاه داده که توسط آزمایشگاه های DIANA پشتیبانی می شود، اکنون حاوی بیش از 500000 ورودی است که آن را به یکی از بزرگترین مجموعه های تعاملات miRNA-gene تبدیل…

آشنایی با پایگاه TarBase v9.0: پایگاه داده جامع میانکنش میکروارنا و ژن ها

 

دانلود فایل حاوی میانکنش بین میکروارناها و ژن ها با استفاده از پایگاه داده TarBase

TarBase v9.0 یک پایگاه داده جامع و به روز است که اطلاعات مربوط به تعاملات بین microRNAها (miRNAها) و ژن‌های هدف آنها را ارائه می‌دهد. این پایگاه داده به طور خاص بر اساس شواهد تجربی بنا شده و به عنوان یک منبع ارزشمند برای محققان در زمینه زیست‌شناسی، ژنتیک و پزشکی محسوب می‌شود.

مزایا و کاربردهای TarBase v9.0

  1. مجموعه داده جامع و مبتنی بر شواهد تجربی: TarBase v9.0 شامل بیش از میلیون‌ها تعامل miRNA-ژن است که همگی توسط آزمایش‌های تجربی معتبر مانند HITS-CLIP، PAR-CLIP و CLASH تأیید شده‌اند. این امر دقت و قابلیت اطمینان داده‌های موجود در پایگاه داده را تضمین می‌کند.

  2. پوشش گسترده: این پایگاه داده نه تنها شامل تعاملات miRNA-ژن در شرایط معمول، بلکه تعاملات مربوط به سلول‌های خاص، ویروس‌ها و حتی تعاملاتی که منجر به تخریب هدف می‌شوند (TDMD) را نیز پوشش می‌دهد. این پوشش گسترده، TarBase v9.0 را به یک منبع جامع برای مطالعه نقش miRNAها در فرآیندهای بیولوژیکی مختلف تبدیل کرده است.

  3. داده‌های غنی و سازمان یافته: هر ورودی در TarBase v9.0 شامل اطلاعات دقیق و جامعی در مورد miRNA، ژن هدف، نوع آزمایش، شرایط تجربی، بافت یا سلول مورد مطالعه و منابع علمی مرتبط است. این سازماندهی مناسب داده‌ها، جستجو و تحلیل اطلاعات را برای کاربران آسان می‌کند.

  4. ابزارهای جستجوی پیشرفته: TarBase v9.0 دارای رابط کاربری قدرتمند و انعطاف‌پذیری است که به کاربران امکان می‌دهد با استفاده از فیلترهای مختلف، اطلاعات مورد نظر خود را به راحتی پیدا کنند. کاربران می‌توانند بر اساس نوع miRNA، ژن، بافت، روش تجربی و سایر معیارها، جستجوی خود را محدود کنند.

  5. ارتباط با سایر پایگاه‌های داده: TarBase v9.0 با سایر پایگاه‌های داده معتبر مانند PubMed ،Ensembl و miRBase مرتبط است. این ارتباط، کاربران را قادر می‌سازد تا به راحتی به اطلاعات تکمیلی در مورد miRNAها و ژن‌های مورد نظر خود دسترسی پیدا کنند.

  6. دسترسی آزاد و رایگان: استفاده از TarBase v9.0 برای همه کاربران آزاد و رایگان است و نیازی به ثبت نام یا ورود به سیستم ندارد. این امر دسترسی آسان و سریع به اطلاعات موجود در پایگاه داده را برای همه فراهم می‌کند.

اهمیت TarBase v9.0

TarBase v9.0 به عنوان یک منبع اطلاعاتی جامع و قابل اعتماد، نقش مهمی در پیشبرد تحقیقات در زمینه miRNA ایفا می‌کند. این پایگاه داده به محققان کمک می‌کند تا:

  • نقش miRNAها را در فرآیندهای بیولوژیکی مختلف شناسایی کنند: با استفاده از اطلاعات موجود در TarBase v9.0، محققان می‌توانند نقش miRNAها را در تنظیم بیان ژن‌ها، رشد و تکوین سلول‌ها، بیماری‌ها و سایر فرآیندهای بیولوژیکی بررسی کنند.
  • targets ژن‌های miRNA را شناسایی کنند: این پایگاه داده به محققان کمک می‌کند تا ژن‌های هدف miRNAها را شناسایی و مکانیسم عمل آنها را بررسی کنند.
  • توسعه روش‌های درمانی جدید: با درک بهتر نقش miRNAها در بیماری‌ها، محققان می‌توانند روش‌های درمانی جدیدی مبتنی بر miRNAها طراحی و توسعه دهند.

نتیجه‌گیری

TarBase v9.0 یک پایگاه داده ارزشمند و ضروری برای محققان، دانشجویان و پزشکان است که در زمینه miRNA تحقیق می‌کنند. این پایگاه داده با ارائه اطلاعات جامع، دقیق و سازمان یافته، به پیشبرد تحقیقات در این زمینه و توسعه روش‌های درمانی جدید کمک می‌کند.

بخش دانلود نرم افزار

برای دانلود فایل حاوی میانکنش بین میکروارناها و ژن ها با استفاده از پایگاه داده TarBaseاز لینک های زیر استفاده کنید

برای دانلود نسخه اصلی از پایگاه داده TarBase کلیک نمایید و یا از لینک زیر استفاده نمایید.

https://dianalab.e-ce.uth.gr/tarbasev9/downloads

 

 

 

آموزش‌های مرتبط

دیدگاه‌ها

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *