توضیحات
عنوان کامل این آموزش:
فیلم فارسی آموزش آنالیز داده های میکرواری (بررسی تغییرات بیان ژنها) با استفاده از نرم افزار R بخش سوم: آموزش آنالیز داده های میکرواری نوع Affymetrix
توضیحات این آموزش:
این آموزش سومین بخش از آموزش آنالیز داده های میکرواری برای بررسی تغییرات بیان ژن ها با استفاده از نرم افزار R می باشد (برای مشاهده سایر بخش ها کلیک نمایید). در این فیلم آموزشی بررسی تغییرات بیان ژن با آنالیز دادهای میکرواری از نوع Affymetrix از ابتدا (خوانش فایل دادههای خام) نرمال سازی، بررسی کیفیت دادهها، فیلتر نمودن دادهها، بررسی تغییرات بیان ژن ها بین گروه های مختلف تا مرحله آنالیز آماری آماری به صورت مرحله به مرحله و جزئیات کامل با استفاده از پکیجهای affy و oligo آموزش داده شده است.
🔹 ویژگیهای این آموزش:
-
آموزش کاملاً عملی و گامبهگام از سطح مقدماتی تا تحلیل دادههای واقعی
-
معرفی و استفاده از ابزارهای معتبر NCBI برای آنالیز دادههای Microarray
-
آموزش کار با پکیجهای oligo و affy بهصورت کاربردی
-
آموزش بررسی کیفیت دادهها و حذف نمونههای بی کیفیت
-
مناسب برای دانشجویان، پژوهشگران و علاقهمندان به بیوانفورماتیک و بیولوژی مولکولی
💡 با مشاهده این مجموعه، یاد میگیرید چگونه دادههای میکرواری را از منابع معتبر جهانی استخراج، تحلیل و بهصورت حرفهای تفسیر کنید تا نتایج پژوهشی خود را با دقت و استاندارد بالا ارائه دهید.
در فیلم زیر، میتوانید بخش اول این آموزش را مشاهده نمایید.
فهرست کامل موارد آموزش داده شده:
فیلم اول:
مدت زمان: 19 دقیقه
محتوا:
بخش تئوری آموزش آنالیز داده های میکرواری افیمتریکس
فیلم دوم:
مدت زمان: 29 دقیقه
محتوا:
آموزش نصب نرمافزار R و Rstudio
آموزش نصب پکیجهای لازم مانند affy و oligo
فیلم سوم:
مدت زمان: 32 دقیقه
محتوا:
آموزش آنالیز دادههای میکرواری با پکیج affy
دانلود فایلهای میکرواری از پلتفورمهای افیمتریکس از پایگاه داده GEO
مرتب سازی جدول اطلاعات نمونهها
آموزش خوانش فایلهای داده با پکیج affy
فیلم چهارم:
مدت زمان: 34 دقیقه
محتوا:
آموزش بررسی کیفیت دادههای خوانش شده
آموزش ترسیم پلات پروبها
آموزش ترسیم باکس پلات
آموزش ترسیم هیستوگرام
آموزش ترسیم نمودار تجزیه RNA
آموزش شناسایی نمونهها با کیفیت کم
آموزش ترسیم نمودار RLE
آموزش ترسیم نموار NUSE
فیلم پنجم:
مدت زمان: 32 دقیقه
محتوا:
آموزش نرمال سازی داده ها و رسم نمودار برای دادههای نرمال شده
فیلم ششم:
مدت زمان: 31 دقیقه
محتوا:
آموزش انجام annotation پروبها
مشخص نمودن ژنهای منتسب برای هر ID و پروب
آموزش شناسایی ژنها با بیان پایین
فیلم هفتم:
مدت زمان: 59 دقیقه
محتوا:
آموزش رسم نمودار PCA
آموزش گروه بندی نمونهها و بررسی شباهت نمونهها و شناسایی نمونههای پرت
آموزش وزندهی به نمونهها برای حذف اثر نمونههای پرت
آموزش آنالیز آماری دادهها و مقایسه میانگین بیان ژنها بین گروهها و محاسبه fold change و p value
آموزش ترسیم نمودار MA و بررسی نرمال سازی صحیح دادهها
استخراج و ذخیره سازی نتایج
فیلم هشتم:
مدت زمان: 39 دقیقه
محتوا:
انجام آنالیزها بر روی مطالعات با بیش از 2 گروه و مقایسه بین گروهها
فیلم نهم:
مدت زمان: 39 دقیقه
محتوا:
ادامه اموزش انجام آنالیزها بر روی مطالعات با بیش از 2 گروه و مقایسه بین گروهها
فیلم دهم:
مدت زمان: 31 دقیقه
محتوا:
آموزش آنالیز دادههای میکرواری با پکیج oligo
آموزش خوانش دادههای نوع gene st با پکیج oligo
بررسی کیفیت دادهها با پکیج oligo با ترسیم نمودارهای مختلف
فیلم یازدهم:
مدت زمان: 37 دقیقه
محتوا:
آموزش نرمال سازی دادهها با پکیج oligo
آموزش انجام annotation پروبها با پکیج oligo
آموزش ترسیم نمودار MA و بررسی نرمالسازی دادهها
آنالیز آماری، محاسبه fold change و p value و ذخیره نتایج
فیلم دوازدهم:
مدت زمان: 45 دقیقه
محتوا:
آموزش خوانش دادههای نوع exon st با پکیج oligo
بررسی کیفیت دادهها با پکیج oligo با ترسیم نمودارهای مختلف
فیلم سیزدهم:
مدت زمان: 66 دقیقه
محتوا:
ادامه آنالیز دادههای نوع exon st
فیلم چهاردهم:
مدت زمان: 35 دقیقه
محتوا:
آموزش ساخت پکیجهای لازم برای خواش فایلهای میکرواری از روی فایل cdf
فیلم پانزدهم:
مدت زمان: 66 دقیقه
محتوا:
انجام آنالیزها با روش vooma برای دادههای میکرواری
🔹 مزیت ویژه آموزش فعلی: ارائه کدهای R
یکی از ویژگیهای برجستهی این دوره، ارائهی دادهها و فایلهای واقعی برای انجام تحلیلها است. تمامی دادهها، کدها و منابع لازم در اختیار شما قرار میگیرد تا بتوانید بهصورت همزمان با مشاهدهی آموزشها، مراحل تحلیل را خودتان اجرا کنید
این ساختار آموزشی باعث میشود فرایند یادگیری شما سریعتر، تعاملیتر و کاربردیتر باشد؛ بهگونهای که در پایان دوره بتوانید تحلیلهای مشابه را بهصورت مستقل طراحی و اجرا کنید.
نقد و بررسیها
هنوز بررسیای ثبت نشده است.