توضیحات

معرفی آموزش رسم نمودار با نرم افزار R در محیط rstudio

در این مجموعه آموزشی جامع، یاد می‌گیرید چگونه با استفاده از نرم‌افزار R و محیط RStudio، انواع نمودارهای علمی و تحلیلی را برای داده‌های پژوهشی رسم کنید. این دوره به‌طور ویژه برای تحلیل داده‌های بیان ژن، Real-Time PCR، RNA-seq، Microarray و سایر داده‌های زیستی طراحی شده است و به شما کمک می‌کند تا نتایج پژوهش‌های خود را به‌صورت گرافیکی، دقیق و قابل انتشار در مقالات علمی ارائه دهید.

آموزش‌ها به‌صورت گام‌به‌گام و کاملاً کاربردی تهیه شده‌اند و نیازی به پیش‌زمینه در برنامه‌نویسی R ندارند. در بخش‌های ابتدایی، نصب نرم‌افزارها و نحوه وارد کردن داده‌ها آموزش داده می‌شود. سپس رسم نمودارهای مختلف شامل Box Plot، Violin Plot، Dot Plot، Line Plot، Bar Plot، Heatmap (معمولی و دایره‌ای)، Volcano Plot، MA Plot و PCA (دو‌بعدی و سه‌بعدی) به‌صورت کامل پوشش داده شده است.

در ادامه، نحوه تحلیل همبستگی ژن‌ها (Pearson و Spearman)، رگرسیون خطی و رسم نمودار Venn برای یافتن ژن‌های مشترک بین گروه‌ها آموزش داده می‌شود. تمام آموزش‌ها با مثال‌های واقعی از داده‌های ژنتیکی همراه هستند تا بتوانید به‌طور عملی و مؤثر مهارت‌های خود را توسعه دهید.

🔹 ویژگی‌های برجسته این آموزش:

• آموزش کامل و پروژه‌محور در محیط R و RStudio

• مناسب برای تحلیل داده‌های بیولوژی مولکولی، ژنتیک و بیوانفورماتیک

• بدون نیاز به دانش قبلی از R یا کدنویسی

• پوشش کامل از نمودارهای پایه تا تحلیل‌های پیچیده چند‌متغیره

• مناسب برای مقالات، پایان‌نامه‌ها و ارائه‌های پژوهشی

💡 با تماشای این آموزش، یاد می‌گیرید چگونه داده‌های خود را به شکلی حرفه‌ای و چشم‌نواز به تصویر بکشید و نمودارهایی تولید کنید که درک نتایج علمی شما را ساده‌تر و اثرگذارتر کنند.

اهمیت رسم نمودار با نرم‌افزار r

پس از انجام تحلیل‌های بیان ژن با روش‌هایی مانند RNA-Seq یا Microarray، و همچنین بررسی الگوهای متیلاسیون ژن‌ها، معمولاً به مجموعه‌ای از ژن‌ها دست می‌یابیم که میان گروه‌های مختلف نمونه‌ها – برای مثال، گروه بیماران و افراد سالم – تغییرات معنی‌داری را در سطح بیان یا متیلاسیون نشان می‌دهند.

برای نمونه، ممکن است مشاهده شود که بیان برخی ژن‌ها در بیماران به‌طور قابل‌توجهی افزایش یا کاهش یافته است، یا میزان متیلاسیون در نواحی پروموتری برخی ژن‌ها تغییر کرده و در نتیجه بر بیان آن‌ها تأثیر گذاشته است.

در چنین شرایطی، ارائه‌ی نتایج به‌صورت بصری و قابل‌درک اهمیت ویژه‌ای دارد. یکی از مؤثرترین روش‌ها برای این منظور، رسم نمودارهای تحلیلی با استفاده از نرم‌افزار R است.

رسم نمودار در تحلیل داده‌های حاصل از Microarray، RNA-Seq و متیلاسیون نقش کلیدی دارد؛ زیرا حجم داده‌ها معمولاً بسیار زیاد است و تفسیر آن‌ها بدون نمایش بصری دشوار خواهد بود. استفاده از نمودارهای مناسب به پژوهشگر کمک می‌کند تا الگوها، تفاوت‌ها و ارتباط‌ها میان گروه‌ها را سریع‌تر و دقیق‌تر شناسایی کند.

علاوه بر این، ارائه‌ی نتایج به‌صورت نمودار باعث می‌شود یافته‌های پژوهش شفاف‌تر، قابل‌فهم‌تر و علمی‌تر ارائه شوند و در گزارش‌ها، مقالات و ارائه‌های علمی جلوه‌ای حرفه‌ای‌تر داشته باشند.

در فیلم زیر، توضیحات کاملی در مورد مزیت‌های این آموزش و نمودارهایی که آموزش رسم آن‌ها توضیح داده شده است ارائه شده است تا پیش از شروع دوره با محتوای آموزشی و اهداف آن به‌خوبی آشنا شوید.

 

مزیت‌های این آموزش به شرح زیر می‌باشد

• ارائه آموزش‌ به صورت 0 تا 100 به صورتی که برای رسم نمودارها نیازی به پیش زمینه نباشد. همه مراحل برای رسم نمودارها به صورت کامل ارائه شده است.

• رسم نمودارهای مختلف برای نتایج آنالیز که این نمودارها از مقالات دریافت شده است و یا مشابه آن‌ها در مقالات موجود می‌باشد. نمودارهایی که ترسیم آن‌ها آموزش داده شده است در پایین همین صفحه ارائه شده است.
• ارائه آموزش‌ها به صورت مرحله به مرحله. در ابتدا توضیح کاربرد هر نمودار ارائه می‌شود و سپس رسم نمودارها به صورت عملی انجام می‌شود.
• ارائه فایل‎‌هایی که برای رسم نمودارها لازم می‌باشد. برای اینکه بتوانید رسم نمودارها را انجام دهید فایل‌هایی که در رسم نمودار استفاده می‌شود در اختیارتان قرار می‌گیرد.
• این آموزش در 23 بخش یا فیلم آموزشی به زبان فارسی ارائه شده است که جزئیات هر فیلم آموزشی در انتهای این صفحه ارائه شده است.
• ارائه پشتیبانی کامل برای آموزش: در صورت مواجهه با مشکل یا نیاز به پشتیبانی برای این آموزش، کافی است تا با شماره 09050250034 در پیام‌رسان‌های تلگرام، واتساپ و یا ایتا در تماس باشد و تصویر خطا و یا مشکل پیش آمده را ارسال نمایید تا راهنمایی‌های لازم برایتان ارائه شود.

فهرست کامل موارد آموزش داده شده:

فیلم اول:

مدت زمان: 13 دقیقه
محتوا: معرفی نمودارهایی که رسم آن‌ها در این آموزش پوشش داده‌شده است.

فیلم دوم:
مدت زمان: 19 دقیقه
محتوا:

آموزش  دانلود و نصب نرم افزارهای R و R studio

آموزش خوانش داده‌ها در نرم افزار R برای رسم نمودار

 

فیلم سوم:
مدت زمان: 28 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار جعبه‌ای (box plot) در نرم‌افزار R به همراه اروربار

فیلم چهارم:
مدت زمان: 16 دقیقه

محتوا:

آموزش رنگ آمیزی نمودار جعبه‌ای (box plot) در نرم‌افزار R و اضافه نمودن طرح (pattern) به ستون‌ها

فیلم پنجم:
مدت زمان: 22 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار جعبه‌ای (box plot) به صورت گروهی در نرم‌افزار R به همراه اروربار

فیلم ششم:
مدت زمان: 24 دقیقه
محتوا:

ادامه آموزش رسم نمودار جعبه‌ای

 

فیلم هفتم:
مدت زمان: 23 دقیقه
محتوا:

آماده سازی جدول داده‌ها برای رسم نمودار در نرم افزار R

 

فیلم هشتم:
مدت زمان: 18 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار ویولین (violin plot) در نرم‌افزار R به همراه اضافه نمودن طرح (pattern) به ستون‌ها

فیلم نهم:
مدت زمان: 28 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار ویولین (violin plot) در نرم‌افزار R برای چند ژن و سازماندهی الگوی نمایش تصاویر

 

فیلم دهم:
مدت زمان: 25 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار نقطه‌ای (dot plot) در نرم‌افزار R

آموزش رسم نمودار نقطه‌ای (dot plot) در نرم‌افزار R برای داده‌های جفت شده

فیلم یازدهم:
مدت زمان: 28 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار خطی (line  plot) در نرم‌افزار به صورت تکی و چند متغیری

فیلم دوازدهم:
مدت زمان: 37 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار ستونی(bar plot) در نرم‌افزار به صورت تکی و گروهی به همراه اضافه نمودن طرح (pattern) به ستون‌ها

فیلم سیزدهم:
مدت زمان: 39 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار heatmap با استفاده از نرم افزار R

آموزش اضافه نمودن اطلاعات به نمودار heatmap

فیلم چهاردهم:
مدت زمان: 26 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار heatmap به صورت دایره‌ای با استفاده از نرم افزار R

فیلم پانزدهم:
مدت زمان: 31 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار آتشفشانی (volcano plot) با استفاده از نرم افزار R

آموزش نمایش اسم ژن‌های منتخب بر روی رسم نمودار آتشفشانی (volcano plot) با استفاده از نرم افزار R

فیلم شانزدهم:
مدت زمان: 13 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار MAبا استفاده از نرم افزار R

آموزش نمایش اسم ژن‌های منتخب بر روی رسم نمودار MA با استفاده از نرم افزار R

فیلم هفدهم:
مدت زمان: 25 دقیقه
محتوا:

آموزش محاسبه مولفه‌های اصلی برای داده‌ها

آموزش رسم نمودار PCA با استفاده از نمودار R و نمایش هر گروه با رنگ و شکل دلخواه

فیلم هجدهم:
مدت زمان: 19 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار PCA سه بعدی با استفاده از نمودار R و نمایش هر گروه با رنگ و شکل دلخواه

فیلم نوزدهم:
مدت زمان: 24 دقیقه
محتوا:

آموزش مشخص نمودن جایگاه کروموزمی هر ژن

آموزش رسم نمودار ژن‌های معنی دار هر کروموزم

فیلم بیستم:
مدت زمان: 18 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم ژن‌های تغییر بیان یافته بر روی کروموزم با استفاده از نرم افزار R

فیلم بیست و یکم:
مدت زمان: 19 دقیقه
محتوا:

آموزش محاسبه همبستگی بین متغیرها یا ژن‌ها با روش پیرسون و اسپیرمن

آموزش رسم نمودار همبستگی بین متغیرها

فیلم بیست و دوم:
مدت زمان: 14 دقیقه
محتوا:

آموزش بررسی ارتباط بین ژن‌ها با روش رگرسیون خطی

آموزش ترسیم نمودار رگرسیون

فیلم بیست و سوم:
مدت زمان: 34 دقیقه
محتوا:

آموزش رسم نمودار ون (venn plot) با استفاده از نرم افزار R

آموزش شناسایی ژن‌های مشترک در نمودار venn

مزیت ویژه این آموزش: دسترسی به فایل‌های واقعی برای تحلیل داده‌ها

یکی از ویژگی‌های بسیار کاربردی این مجموعه آموزشی، ارائه تمامی فایل‌های موردنیاز برای رسم نمودارها است. با در اختیار داشتن این فایل‌ها، شما می‌توانید به‌صورت هم‌زمان با آموزش، مراحل رسم نمودار را خودتان انجام دهید و به درک عمیق‌تری از فرآیند کار برسید.

فایل‌هایی که در این دوره ارائه می‌شوند شامل موارد زیر هستند:

• فایل‌های داده‌ی بیان ژن‌ها که از آن‌ها برای رسم نمودارها استفاده می‌شود. این فایل‌ها شامل اطلاعات مربوط به نمونه‌ها، داده‌های نرمال‌شده‌ی بیان ژن‌ها، و داده‌های مربوط به میزان تغییر بیان ژن‌ها هستند.
• همچنین، فایل‌های کد کامل R نیز در اختیار شما قرار داده شده‌اند. این کدها به‌صورت منظم و هماهنگ با ویدئوهای آموزشی تنظیم شده‌اند تا بتوانید هم‌زمان با مشاهده‌ی آموزش‌ها، کدها را اجرا کرده و نمودارهای مورد نظر را رسم کنید.

ارائه این فایل‌ها باعث می‌شود شما بتوانید تمامی مراحل تحلیل را به‌صورت عملی انجام دهید، و در نتیجه، فرآیند یادگیری برایتان سریع‌تر، مؤثرتر و کاربردی‌تر باشد.