توضیحات

درباره این آموزش:

یکی از روش های آنالیز داده های ریل تایم ترسیم منحنی استاندارد جهت سنجش میزان مطلق ژن هدف در نمونه ها می باشد. این روش آنالیز داده های ریل تایم دارای کاربردهای خاص خود می باشد به عنوان مثال با تعیین تعداد نسخه های یک ژن برای نمونه‌های تومری و سالم، می‌توان تغییرات بیان ژن‌ها را مورد بررسی قرار داد. در اين روش از یک نمونه RNA يا DNA با غلظت مشخص براي رسم منحني استاندارد استفاده مي شود. ابتدا غلظت RNA يا DNA استاندارد با روش اسپکتروفوتومتر تعيين مي شود و سپس با استفاده از وزن مولکولی RNA يا DNA می توان تعداد نسخه های RNA يا DNA را در نمونه استاندارد تعیین نمود. سپس از نمونه استاندارد یک سری رقت متوالی که تعداد نسخه های ژن هدف و یا میزان آن به نانوگرم مشخص است تهیه می شود و از آن ها برای ترسیم منحنی استاندارد استفاده می شود. در این روش علاوه بر نمونه های حاصل از رقت های متوالی، نمونه های مورد بررسی (که تعداد نسخه ژن هدف باید در آن ها تعیین گردد) نیز با ریل تایم بررسی و میزان Ct برای همه نمونه ها مشخص خواهد شد. در مرحله بعد يک نمودار از نمونه هاي رقيق شده ترسیم می گردد بدين صورت که محور X بیانگر تعداد کپي ژن هدف و محور Y ميزان Ct هر نمونه می باشد، در ادامه با مقایسه Ct نمونه هدف با نمودار استاندارد ترسیم شده می توان ميزان کپي و يا غلظت ژن هدف را آن نمونه ها به دست آورد.

در این آموزش آنالیز داده های ریل تایم  به روش absolute quantification آموزش داده شده است. در این آموزش ابتدا نحوه تعیین تعداد نسخه یک ژن و تهیه رقت با استفاده از DNA ژنومی، پلاسیمد (وکتور)، محصول PCR و RNA با استفاده از فرمول‌های مربوطه آموزش داده شده است و سپس روش تعیین تعداد نسخه های یک ژن در نمونه با استفاده از ترسیم منحنی استاندارد توضیح داده شده است.

در فیلم زیر، توضیحات کاملی در مورد مزیت‌های این آموزش، مباحث پوشش داده‌شده و کاربردهای علمی و پژوهشی آن ارائه شده است تا پیش از شروع دوره با محتوای آموزشی و اهداف آن به‌خوبی آشنا شوید.

همچنین در فیلم زیر می‌توانید بخشی از آموزش را به صورت رایگان تماشا نمایید.

مزیت‌های این آموزش به شرح زیر می‌باشد

• ارائه آموزش‌ به صورت 0 تا 100 به صورتی که برای انجام آنالیزها نیازی به پیش زمینه نباشد. همه مراحل از آماده سازی داده‌ها برای آنالیز تا انجام آنالیز و رسم نمودار و تفسیر نتایج به صورت کامل ارائه شده است.

• رسم نمودارهای مختلف برای نتایج آنالیز که این نمودارها از مقالات دریافت شده است و یا مشابه آن‌ها در مقالات موجود می‌باشد. نمودارهایی که ترسیم آن‌ها آموزش داده شده است در پایین همین صفحه ارائه شده است.
• ارائه آموزش‌ها به صورت مرحله به مرحله. در ابتدا توضیح تئوری هر آنالیز ارائه می‌شود و سپس آنالیزها به صورت عملی انجام می‌شود و در ادامه تفسیر نتایج به دست آمده ارائه می‎شود.
• ارائه فایل‎‌هایی که برای آنالیز لازم می‌باشد. برای اینکه بتوانید آنالیزها را انجام دهید فایل‌هایی که در آنالیز  و رسم نمودار استفاده می‌شود در اختیارتان قرار می‌گیرد.
• این آموزش در 18 بخش یا فیلم آموزشی به زبان فارسی ارائه شده است که جزئیات هر فیلم آموزشی در انتهای این صفحه ارائه شده است.
• ارائه پشتیبانی کامل برای آموزش: در صورت مواجهه با مشکل یا نیاز به پشتیبانی برای این آموزش، کافی است تا با شماره 09050250034 در پیام‌رسان‌های تلگرام، واتساپ و یا ایتا در تماس باشد و تصویر خطا و یا مشکل پیش آمده را ارسال نمایید تا راهنمایی‌های لازم برایتان ارائه شود.

اهمیت بررسی بیان ژن‌ها به روش مطلق (Absolute Quantification)

بررسی بیان ژن‌ها به روش مطلق (Absolute Quantification) در تکنیک Real-Time PCR از اهمیت بالایی برخوردار است، زیرا این روش امکان اندازه‌گیری دقیق و واقعی تعداد نسخه‌های RNA یا DNA هدف را در هر نمونه فراهم می‌کند. برخلاف روش نسبی (Relative Quantification) که نتایج آن وابسته به ژن‌های مرجع یا نمونه‌های کنترل است، روش مطلق داده‌هایی کاملاً کمی، دقیق و قابل‌مقایسه میان آزمایش‌های مختلف ارائه می‌دهد. این ویژگی موجب می‌شود پژوهشگران بتوانند تغییرات واقعی بیان ژن‌ها را با اطمینان بیشتری تحلیل کرده و در مطالعات حساس مانند تشخیص بیماری‌ها، بررسی اثر داروها و تحلیل مسیرهای مولکولی از نتایج قابل استناد و تکرارپذیر بهره‌مند شوند

فهرست کامل موارد آموزش داده شده:

فیلم اول:

مدت زمان: 5 دقیقه
محتوا: مباحث پوشش داده‌شده در این آموزش

فیلم دوم:
مدت زمان: 35 دقیقه
محتوا:

آموزش ساخت محلول استاندارد از توالی‌های سنتز شده

آموزش ساخت محلول استاندارد از توالی‌های تکثیر شده توسط PCR

آموزش ساخت محلول استاندارد از توالی‌های کلون شده در وکتورها

آموزش ساخت محلول استاندارد از توالی‌های RNA

فیلم سوم:
مدت زمان: 13 دقیقه
محتوا:
آموزش محاسبه تعداد نسخه ژن در هر میکرولیتر از RNA استخراج شده

آموزش محاسبه تعداد نسخه ژن در هر میکروگرم از بافت

آموزش محاسبه تعداد نسخه ژن در هر میلی‌لیتر از محلول

فیلم چهارم:
مدت زمان: 12 دقیقه

محتوا:
آموزش ساخت محلول استاندارد، منحنی استاندارد و محاسبه تعداد نسخه ژن در هر میکرولیتر از RNA بر اساس مقاله مربوطه

فیلم پنجم:
مدت زمان: 9 دقیقه
محتوا:
اصول تئوری بررسی کیفیت داده‌های ریل تایم PCR
آشنایی با منحی تکثیر و منحنی ذوب در ریل تایم PCR

فیلم ششم:
مدت زمان: 23 دقیقه
محتوا:
آموزش استخراج داده‌های ریل تایم PCR از نرم افزارهای ABI stepone ، cfx manager biorad و light cycler 96

آموزش بررسی منحنی تکثیر و منحنی ذوب در نرم افزارهای ABI stepone ، cfx manager biorad و light cycler 96

فیلم هفتم:
مدت زمان: 12 دقیقه
محتوا:
ادامه بررسی کیفیت داده‌های ریل تایم PCR
شناسایی داده‌های پرت و اصلاح آن‌ها

فیلم هشتم:
مدت زمان: 28 دقیقه
محتوا:
آموزش رسم منحنی استاندارد با نرم افزار گرافپد پریزم
آموزش محاسبه کارایی پرایمر از روی منحنی استاندارد
آموزش محاسبه تعداد نسخه ژن در هر میکرولیتر از RNA استخراج شده

فیلم نهم:
مدت زمان: 17 دقیقه
محتوا:
آموزش رسم نمودار با استفاده از نرم افزار گرافپد پریزم برای نمایش تغییرات بیان ژن‌ها بین گروه‌ها

فیلم دهم:
مدت زمان: 19 دقیقه
محتوا:
آموزش انتخاب آزمون مناسب برای مقایسه بیان ژن بین گروه‌ها با آزمون T و من‌ویتنی
بررسی نرمال بودن توزیع داده‌ها بین گروه‌های مختلف با نرم افزار گرافپد پریزم
آموزش مقایسه اماری بین گروه‌ها با استفاده از نرم افزار گرافپد پریزم

فیلم یازدهم:
مدت زمان: 23 دقیقه
محتوا:
آموزش محاسبه تعداد و درصد مشخصات نمونه‌ها (مثل سن، جنسیت، گرید و استیج بیمار) در بین گروه‌های مختلف با نرم افزار SPSS
آموزش محاسبه میانگین، استاندارد ارور و … برای متغیرها در بین گروه‌های مختلف با نرم افزار SPSS
بررسی نرمال بودن توزیع داده‌ها بین گروه‌های مختلف با SPSS
آموزش مقایسه اماری بین گروه‌ها با استفاده از نرم افزار SPSS با آزمون T و من‌ویتنی

فیلم دوازدهم:
مدت زمان: 23 دقیقه
محتوا:
آموزش انتخاب آزمون مناسب برای مقایسه بیان ژن بین گروه‌ها – برای بیش از دو گروه
آموزش مقایسه اماری بین گروه‌ها با استفاده از نرم افزار گرافپد پریزم با استفاده از آزمون anova و کروسکال-والیس (Kruskal-Wallis)
ادامه رسم نمودار با نرم افزار گرافپد پریزم

فیلم سیزدهم:
مدت زمان: 26 دقیقه
محتوا:
آموزش مقایسه اماری بین گروه‌ها با استفاده از نرم افزار SPSS با استفاده از آزمون anova و کروسکال-والیس (Kruskal-Wallis)

فیلم چهاردهم:
مدت زمان: 15 دقیقه
محتوا:

ادامه رسم نمودار با نرم افزار گرافپدپریزم

فیلم پانزدهم:
مدت زمان: 21 دقیقه
محتوا:

بررسی ارتباط بین ژن‌ها با آزمون رگرسیون خطی

بررسی همبستگی بین ژ‌ن‌ها با روش پیرسون و اسپیرمن

فیلم شانزدهم:
مدت زمان: 11 دقیقه
محتوا:

آموزش آنالیز بیومارکر برای ژن‌ها

آموزش رسم منحنی راک

آموزش تعیین بهترین نقطه کات‌آف برای بیومارکر

فیلم هفدهم:
مدت زمان: 13 دقیقه
محتوا:

آموزش نرمال سازی داده‌های بیانی بر اسا مقاله مربوطه

فیلم هجدهم:
مدت زمان: 1 دقیقه
محتوا:

سخنان پایانی

 

مزیت ویژه این آموزش: دسترسی به فایل‌های واقعی برای تحلیل داده‌ها

یکی از ویژگی‌های بسیار کاربردی این مجموعه آموزشی، ارائه تمامی فایل‌های موردنیاز برای تحلیل داده‌ها است. با در اختیار داشتن این فایل‌ها، شما می‌توانید به‌صورت هم‌زمان با آموزش، مراحل تحلیل را خودتان انجام دهید و به درک عمیق‌تری از فرآیند کار برسید.

فایل‌هایی که در این دوره ارائه می‌شوند شامل موارد زیر هستند:

• فایل‌های نرم‌افزار Real-Time PCR که از آن‌ها برای استخراج مقادیر CT و بررسی کیفیت داده‌ها استفاده می‌شود.

• فایل‌های داده CT که به کمک آن‌ها منحنی استاندارد رسم شده و تعداد نسخه‌های هر ژن در نمونه‌ها به‌صورت دقیق محاسبه می‌گردد.

ارائه این فایل‌ها باعث می‌شود شما بتوانید تمامی مراحل تحلیل را به‌صورت عملی انجام دهید، و در نتیجه، فرآیند یادگیری برایتان سریع‌تر، مؤثرتر و کاربردی‌تر باشد.