آشنایی با پایگاه داده tarbase برای بررسی میانکش میکروارنا و ژن هدف
میکروارنا ها (microRNA یا miRNA) ها یک رده از RNA های تنظیم کننده کوچک درون هسته ای و غیرکدکننده پروتئینی که متشکل از حدود 17-22 نوکلئوتید می باشند. میکروارنا ها بیان ژن را پس از رونویسی از طریق تجزیه mRNA یا مهار ترجمه انها کنترل کرده و نقش های متنوعی را در فرایند های بیولوژیکی و متابولیکی در گیاهان و جانوران بازی می کنند. تا کنون با روش های آزمایشگاهی و به صورت تجربی بسیاری از ژن های هدف میکروارناها شناسایی و تایید شده اند. پایگاه داده tarbase یکی از بانک های اطلاعاتی می باشد اقدام به جمع آوری ژنهای هدف میکروارنا نموده است. در این پایگاه همه ژن های هدف ارائه شده برای میکروارنا به صورت عملی و در آزمایشگاه بررسی شده اسن و نتایج میانکنش بین ژن هدف و میکروارنا مورد تایید قرار گرفته است. از این نتایج می توان برای ترسیم شبکه های میانکنشی بین ژن ها و میکروارناها استفاده نمود.
بخش دانلود:
در این قسمت میتوانید میانکنشهای تایید شده بین میکروارنا ها و ژن های هدف را از پایگاه tarbase دانلود نمایید.
میانکنش بین میکروارناها با ژن ها از پایگاه tarbase به دست آمده است.
این میانکنشها به صورت عملی و در آزمایشگاه مورد تایید قرار گرفته است
روش بررسی میانکنش میکروارناها با ژن ها در این فایل ذکر شده است.
مطالعات صورت گرفته متعلق به گونه انسان ، موش و چند گونه دیگر می باشد.