میکروارناها در قلمرو گیاهان و حیوانات دیده شده که توسط روشهای نامشخصی از روی ژن ها کد میشوند و به وسیله RNA پلیمراز II رونویسی میشوند و در نهایت capping و پلی آدنیالسیون صورت میگیرد. اگر چه تعدادی از miRNAهای حیوانی منحصرا از واحدهای رونوشت جداگانه ایجاد میشوند اما بیشتر miRNAها از واحدهای رونویسی که تولید بیش از یک محصول را می نمایند، ایجاد می شوند. یک رونوشت ممكن است مجموعهای از miRNAها یا یک miRNA همراه یک پروتئین را تولید نماید و آخرین نوع رونوشت آنهایی هستند که توالی miRNA داخل نواحی اینترون قرار دارد.
تفكر بر این است که miRNAهای جدید حیوانی نه به دلیل دو برابر شدن قطعه ژنی، بلكه به خاطر تجمع توالیهای نوکلئوتیدی تغییر یافته ایجاد میشوند. در ادامه pri-miRNA از توالی َ5و َ3 مولكول miRNA تولید میشود که تبدیل رونوشت miRNA به miRNA بالغ در دو مرحله انجام می پذیرد.
شکل فوق بیانگر تفاوت عملکرد و مکانیسم میکروارناها (microRNA ) در حیوانات و گیاهان برای تنظیم بیان ژن ها میباشد.
اتصال میکروارناها به توالی هدف در گیاهان منجر به برش و تجزیه توالی هدف می شود اما در حیوانات اتصال میکروارنا به توالی هدف سبب جلوگیری از ترجمه توالی هدف به پروتئین می شود. اما در صورتی که اتصال میکروارنا در حیوانات به صورت کامل باشد می تواند منجر به برش توالی هدف نیز گردد.
انجام پردازشها بستگی به تشكیل ساختار ساقه- حلقه توالی miRNA دارد. یک pri-miRNA متداول در حیوانات دارای یک جفت شدگی ناقص با حلقه 33 نوکلئوتیدی و یک حلقه انتهایی و توالی بین آنها میباشد. اولین مرحله برای تشكیل miRNA بالغ در هسته انجام میپذیرد و شامل برش ساقه- حلقه باقی مانده از رونوشت که برای بیشتر pri-miRNA ها به وسیله یكی از اعضای خانواده آنزیمی RNase III که در گیاهان Dcl9 و در حیوانات دروشا نامیده میشود، صورت میپذیرد. دومین مرحله در تشكیل miRNAهای بالغ، برش حلقه انتهایی از ساقه ی pre-miRNA و ایجاد miRNA بالغ دو رشتهای به طول 22 نوکئوتید میباشد که در گیاهان توسط Dcl درون هسته صورت گرفته اما در حیوانات pre-miRNA از هسته خارج شده و آنزیمهای دایسر در سیتوپلاسم برش را انجام میدهند.