این فایل اکسل برای آنالیز بسیار آسان داده های ریل تایم طراحی شده است با استفاده از این فایل می توان تنها با وارد نمودن داده های CT و بدون نیاز به تنظیمات دیگر تغییرات بیان ژن ها را بین چند گروه مورد بررسی قرار داد.
وبسایت Hugo یک کمیته برای نام گذاری ژنهای انسانی می باشد. از آن جایی که ارائه نام صحیح و علمی ژنها در متون علمی مثل مقالات و پایان نامه ها بسیار ضروری می باشد، با استفاده از این پایگاه می توان اسم رسمی ژن ها را جستجو نمود.
در این آموزش ابتدا نحوه دریافت توالی یک اگزون از ژن در یاپگاه داده NCBI آموزش داده شده است، در ادامه نحوه طراحی پرایمر برای توالی یابی این قطعه با استفاده از نرم افزار primer 3 ارائه شده است.
اولین مرحله برای طراحی پرایمر به دست آوردن توالی ژن هدف می باشد، برای موجوداتی که توالی ژنوم آن ها در دسترس نمی باشد می توان با استفاده از دادههای RNAseq توالی ژن هدف را شناسایی نمود و برای این توالی طراحی پرایمر نمود.
بانک اطلاعاتی mirbase پایگاه جامعی از اطلاعات مربوط به توالی‌های میکروارناها می‌باشد که به آدرس mirbase.org در دسترس است. با جستجو در این پایگاه می توان توالی میکروارنا در همه گونه ها را به دست آورد.
نرم افزار RNAhybrid یک ابزار بیوانفورماتیکی برای شناسایی ژن های هدف میکروارناها می باشد. علاوه براین با استفاده از این نرم افزار میتوان ساختار و نحوه اتصال میکروارناها به ژن هدف را به صورت کمی مورد بررسی قرار داد.
تا کنون با روش های آزمایشگاهی و به صورت تجربی بسیاری از ژن های هدف میکروارناها شناسایی و تایید شده اند. در این قسمت میتوانید میانکنشهای تایید شده بین میکروارنا ها و ژن های هدف را از پایگاه tarbase دانلود نمایید.
تا کنون با روش های آزمایشگاهی و به صورت تجربی بسیاری از ژن های هدف میکروارناها شناسایی و تایید شده اند. در این قسمت میتوانید میانکنشهای تایید شده بین میکروارنا ها و ژن های هدف را از پایگاه miRecords دانلود نمایید.
تا کنون با روش های آزمایشگاهی و به صورت تجربی بسیاری از ژن های هدف میکروارناها شناسایی و تایید شده اند. در این قسمت میتوانید میانکنشهای تایید شده بین میکروارنا ها و ژن های هدف را از پایگاه mirtarbase دانلود نمایید.
