متیلاسیون DNA یکی از مکانیسم های اصلی در تنطیم بیان ژن ها می باشد و تغییرات متیلاسیون در نقاط CpG ژن ها مخصوصاً در جزایر CpG می‌تواند سبب تغییر در فنوتیپ موجودات و بروز پدیده هایی مانند سرطان و بیماری ها گردد. از این رو بررسی تغییرات متیلاسیون در ژن ها می تواند یکی آشکار کننده نحوه تغییر بیان ژن‌ها در فنوتیپ های مشاهده شده، باشد.

نرم افزار Methyl Primer Express یکی از نرم افزارهای پایه در زمینه انجام پروژه‌های ژنتیک و بیوتکنولوژی می باشد با استفاده از این نرم افزار می توان به آسانی برای بررسی متیلاسیون در ژن ها طراحی پرایمر نمود.

قابلیت های نرم افزار Methyl Primer Express:

 طراحی پرایمر برای بررسی متیلاسیون با روش Bisulfite sequencing PCR  (یا BSP)

 طراحی پرایمر برای بررسی متیلاسیون با روش MSP