میکروارناها می توانند در در سطوح متفاوتی از فعالیت ژنوم مانند ساختار کروماتین، تفكیک کروموزومی، رونویسی، پردازش، پایداری RNA و ترجمه به تنظیم بیان ژن ها بپردازند. اما در سنتز و پردازش آن ها بین گیاهان و حیوانات تفاوت هایی وجود دارد.
RNA های غیر کدشونده siRNAs ، MicroRNAها و piRNA می توانند در در سطوح متفاوتی از فعالیت ژنوم مانند ساختار کروماتین، تفكیک کروموزومی، رونویسی، پردازش، پایداری RNA و ترجمه به تنظیم بیان ژن ها بپردازند.
روش TGS سبب خاموشی ژن در سطح رونویسی میگردد و در این روش برای کاهش بیان ژن ها، RNAهای مداخله گر یا RNAi سبب متیله شدن کروماتین و سرکوب بیان ژن مورد نظر می گردد.
یکی از روش های شناسایی نقش ژن ها و پروتین ها در سلول، روش خاموش سازی ژن ها و یا کاهش بیان ژن ها می باشد. خاموشی ژن ها بر اثر هتروکروماتین نمودن DNA و یا با استفاده از توالی های مشابه با ژن مورد نظر امکان پذیر میباشد.
ژنتیک معکوس یکی از ابزارهای قوی جهت برقراری ارتباط مستقیم بین عملکرد بیوشیمیایی محصول یک ژن و نقش آن در موجود زنده می باشد که در سال ۱۹۸۰ ابداع شد که مهمترین هدف آن کاهش سطح محصولات ژن می باشد.
