آموزش بیوانفورماتیک

توضیح روش VNTR  (تفاوت در تعداد قطعات پشت سر هم) و کاربرد های آن چیست

توالی های VNTR   توالی های VNTR  یا ماهوارك‌ها قسمتي از DNA هستند كه شامل رديف‌هاي تكراري بوده و تحت عنوان توالي هاي تكراري پشت سرهم با تعداد متنوع يا VNTRS [1] ناميده مي‌شوند. اين واحدها به صورت پراكنده در ژنوم وجود داشته و هرواحد تكرار شونده داراي 60-10 جفت باز بوده كه به صورت پي‌درپي صدها…

توضیح روش VNTR  (تفاوت در تعداد قطعات پشت سر هم) و کاربرد های آن چیست

توالی های VNTR  

توالی های VNTR  یا ماهوارك‌ها قسمتي از DNA هستند كه شامل رديف‌هاي تكراري بوده و تحت عنوان توالي هاي تكراري پشت سرهم با تعداد متنوع يا VNTRS [1] ناميده مي‌شوند. اين واحدها به صورت پراكنده در ژنوم وجود داشته و هرواحد تكرار شونده داراي 60-10 جفت باز بوده كه به صورت پي‌درپي صدها و حتي هزاران بار تكرار مي‌شوند. به نظر مي‌رسد اين توالي‌ها مناطق غيركد‌كننده DNA را شامل مي‌شوند. براي تعيين چندشكلي در اين روش، ابتدا DNA ژنومي توسط آنزيم‌هاي محدودگر برش داده مي‏شود. سپس قطعات با الكتروفورز جداسازي مي‌گردند و لكه‌گذاري ساترن[2] انجام گرفته و دورگه‌سازي با كاوشگرهايي با توالي‌هاي تكراري جهت شناسايي قطعات با طول متفاوت انجام مي‌‌گردد. به اين ترتيب از روي تنوع واحدهاي تكراري، چند شكلي تعيين مي‌‌گردد. از نشانگرهاي ماهوارك به خوبي براي شناسايي افراد و تعيين رابطه خويشاوندي بين افراد استفاده مي‏شود. زيرا مقدار زيادي از تنوع در داخل جمعيت‌ها قابل بررسي مي‌باشد. همچنين از اين تكنيك‌ جهت تهيه نقشه‌هاي پيوستگي ژنتيكي استفاده مي‏شود.

معایب روش VNTR چیست

معايب اين نشانگر، استفاده از مواد راديو‌اكتيو، تهيه كاوشگرهاي مصنوعي و توليد تعداد زيادي باند كه تفسير نتايج را مشكل مي‌سازد، مي‌باشد(Karp et al. 1998).


 

[1] Variable Number of Tandom Repeatates

[2] Southern blotting

آموزش‌های مرتبط

دیدگاه‌ها

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *